Penelitian dengan jelas mengidentifikasi bahwa status kesehatan berpengaruh langsung terhadap hasil-hasil pembelajaran, baik dalam kemampuan memahami, tingkat kehadiran di sekolah, maupun tingkat putus sekolah. Ada sejumlah faktor resiko yang mungkin menyebabkan anak-anak di Indonesia, seperti di negara berkembang pada umumnya, masuk sekolah dengan status gizi rendah.
Banyak anak dilahirkan dengan berat badan di bawah normal akibat ibunya menderita defisiensi kronis dan masalah kesehatan selama hamil, praktik-praktik penyapihan yang keliru, dikombinasikan dengan penyakit malaria yang sering kambuh, infeski saluran pernapasan dan infeksi parasit lain pada usia balita, mengakibatkan tingkat pertumbuhan anak rendah dan sistem kekebalan mereka lemah. Rendahnya asupan gizi yang berlangsung lama, dan masalah spesifik lain seperti defisiensi vitamin, mineral dan iodium pada usia awal sekolah, juga dapat membahayakan perkembangan fisik dan intelektual.
